なんかPHP停止の件、解決しました。 原因は.htaccessだったようですが、これがトラップでした。 FFFTPでは表示されないくせに、ブラウザ上のExplorerでは表示されていて、非常にめんどくさかったです。 FC2では表示されていたのでそれが混乱のもとでした。